CONTENTS
- 1. 관세조사 전 준비사항
- - 준비 사항
- - 사전 준비 체크리스트
- 2. 관세조사 절차별 대응 방법
- - 사전 통지 단계
- - 조사 개시 단계
- - 조사 진행 단계
- - 조사 종료 단계
- - 결과 통지 단계
- - 고지서 발부 단계
- 3. 관세조사 결과가 부당하다면
- - 변호사의 조력이 필요
1. 관세조사 전 준비사항

관세조사란 수출입을 진행하는 기업에 대해 신고세액의 정확성과 수출입 요건 등 거래 행위 전반에 걸쳐 적법성과 적정성을 심사하는 절차를 말합니다.
방문 또는 서면으로 관세 조사가 진행되며, 주로 납세자의 장부나 서류 등을 조사, 분석합니다.
다음의 경우 정기 관세 조사 또는 비정기 관세 조사를 받게될 수 있습니다.
관세조사의 대상
정기 관세 조사 | 비정기 관세 조사 |
정기적 신고 성실도 분석결과 불성실 혐의가 있는 경우 | 신고 등 납세협력의무 불이행한 경우 |
장기(최근 4년 이상) 고나세조사를 받지 않은 경우 | 구체적인 탈세제보 등이 있는 경우 |
무작위추출방식 표본조사를 하는 경우 | 신고 내용에 탈세나 오류 혐의를 인정할 만한 자료가 있는 경우 |
관세조사의 대상이 되었다면, 사전에 준비해 놓는 것이 좋습니다.
준비 사항
관세조사 통지를 받았다면, 실제 조사 시작 전까지의 준비 기간을 전략적으로 활용해야 합니다.
우선 통지서에 기재된 조사 범위, 대상 기간, 조사 유형(정기/비정기/기획 등)을 명확히 파악해야 합니다.
이후 해당 범위에 포함되는 자료를 신속히 준비해야 합니다.
특히 관세평가, 세율 적용, 감면혜택 적용 여부 등에 대한 리스크를 선제적으로 점검하는 것이 좋습니다.
이때 유사 사례나 행정해석을 토대로 내부 입장을 정리해두는 것이 중요합니다.
또한 필요시 관세전문위원, 세무사, 변호사 등 전문가 자문을 통해 조사 대응 전략을 수립해두는 것이 좋습니다.
이를 통해 조사 당일 혼선이나 불리한 진술을 예방할 수 있습니다.
사전 준비 체크리스트
사전 준비 체크리스트를 통해 🔗관세조사 시작 전 충분히 준비해 두는 것이 좋습니다.
- 조사 범위 / 기간 / 유형(정기·비정기·기획 등)
▷ 조사 대비 주요 자료 정리
- 수입신고서, 거래계약서, 원산지증명서, 회계장부 등
▷ 주요 이슈 사전 점검
- 관세평가, 세율 적용, 감면 혜택의 적법성
- 유사 사례 및 행정해석 검토
▷ 전문가 자문 및 대응 전략 수립
- 관세전문위원, 세무사, 변호사 등과 협력
2. 관세조사 절차별 대응 방법

관세조사의 절차를 이해하는 것은 현명하게 대응할 수 있는 첫 번째 방법입니다.
절차별 대응 방법에 대해 살펴보겠습니다.
사전 통지 단계
관세청은 조사 개시 15일 전까지 ‘관세 조사 통지서’를 송달합니다.
이 시점부터는 즉시 관세 전문가와 대응전략을 수립해야 하며, 조사범위와 대상기간을 분석하고 내부 자료 정비를 시작해야 합니다.
주요 대응 포인트
▷ 통지서 수령 후 즉시 사내 조사 대응팀 구성 및 법률·세무 대리인의 자문 받기
조사 개시 단계
조사 당일, 조사공무원의 신분 확인 후 '청렴서약서'를 작성하게 됩니다.
이때 납세자의 권리·의무에 대한 설명이 제공되므로 내용 숙지가 중요합니다.
주요 대응 포인트
▷ 모든 질의응답은 기록에 남기고, 불명확한 질문에는 즉답을 피하고 확인 후 답변
조사 진행 단계
조사기간 동안 납세자는 회계장부, 수입신고서, 계약서 등 관계서류를 요구에 따라 제출해야 합니다.
이때 필요시 관세전문위원 등 전문가의 조력을 받을 수 있습니다.
주요 대응 포인트
▷ 필요시 의견서 제출 및 법률검토 병행
▷ 실무자는 임의로 해석하여 설명x
▷ 공식 회신자료나 증빙으로 대응
조사 종료 단계
원칙적으로 예정된 기간 내에 조사가 종료됩니다,
다만 부득이한 경우 연장될 수 있습니다.
또한조사 종료 전에는 비공식 컨설팅을 통해 오류 보완 기회가 주어질 수 있습니다.
주요 대응 포인트
▷ 쟁점 사항을 사전 점검하고 내부 검토
▷ 성실신고 유도를 위한 개선방안, 기업 편의제도 내용 메모 및 활용
결과 통지 단계
‘관세 조사 결과 통지서’가 송달되며, 과세 예정 내역이 포함될 수 있습니다.
이에 대해 이의가 있는 경우 30일 이내 ‘과세전적부심사’를 청구할 수 있습니다.
주요 대응 포인트
▷ 후속 불복절차로 가기 전 유리한 합리적 조정의 기회인 과세전적부심사 적극 활용
고지서 발부 단계
과세처분이 확정되면 ‘납부고지서’가 발부됩니다.
이때 이의가 있다면 90일 이내 이의신청 또는 심판청구, 이후 행정소송까지 제기할 수 있습니다.
주요 대응 포인트
▷ 사실관계에 기반한 항변논리 정리
▷ 동일 사례가 있는 경우, 이를 인용해 실익 있는 방어 전략 수립
3. 관세조사 결과가 부당하다면

관세조사 후 최종적인 납부고지서를 받았는데 부당하다고 생각된다면 사후 불복제도를 통해 불복할 수 있습니다.
이의신청, 심사·심판청구 등이 있으며, 90일 이내에 청구할 수 있습니다.
이때 이의신청을 꼭 거쳐야 하는 것은 아님으로 생략하고 심사 또는 심판을 청구할 수 있습니다.
만약 이를 통해서도 구제받지 못했다면, 90일 이내에 행정법원에 행정소송을 제기하면 됩니다.
이때 청구서에는 부과된 관세 등이 위법 또는 부당하다는 구체적인 의견과 이를 입증할 수 있는 증거자료 등이 제출되어야 합니다.
따라서 개인이 혼자서 불복 절차를 밟기보다, 전문성을 갖춘 🔗관세변호사 추천을 통해 도움을 받아 해결하는 것이 좋습니다.
변호사의 조력이 필요
법무법인 대륜에는 관세법 관련 전문지식을 보유한 관세변호사가 다수 소속되어 있습니다.
또한 관세전문위원, 공인회계사, 세무사 등 분야별 전문가 역시 다수 포진되어 있는데요,.
관세에 대한 전문지식을 바탕으로 상황에 맞는 대응 방안을 제시하며 조력을 제공하고 있습니다.
또한 관세 조사를 앞둔 기업에 대해 관세상담과 컨설팅 또한 진행하고 있는데요.
만약 관련 조력이 필요하시다면 언제든 🔗관세변호사 법률상담예약을 통해 사건을 의뢰해 주시길 바랍니다.