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법률정보

관세조사 전 준비 사항 및 절차별 대응 방법

관세조사는 수출입을 진행하는 기업의 거래 행위 전반에 대해 적법성을 심사하는 절차입니다. 준비 사항과 조사 시 유의할 대응 방법에 대해 알아두는 것이 중요합니다.

CONTENTS
  • 1. 관세조사 전 준비사항arrow_line
    • - 준비 사항
    • - 사전 준비 체크리스트
  • 2. 관세조사 절차별 대응 방법arrow_line
    • - 사전 통지 단계
    • - 조사 개시 단계
    • - 조사 진행 단계
    • - 조사 종료 단계
    • - 결과 통지 단계
    • - 고지서 발부 단계
  • 3. 관세조사 결과가 부당하다면arrow_line
    • - 대응 전략

1. 관세조사 전 준비사항

관세조사 준비 사항 법률 정보



관세조사란 「관세법」 제2조 제20호에 따라 관세의 과세표준과 세액의 결정 또는 경정하기 위하여 방문 또는 서면으로 납세자의 장부ㆍ서류 또는 그 밖의 물건을 조사(법 제110조의2에 따라 통합하여 조사하는 것을 포함한다)하는 것을 말합니다.

이전에는 ‘기업심사’로 불리었으나, 2023년 국정감사 및 감사원 감사의 지적에 따라 법적 용어를 정비하였고 이후 ‘관세조사’로 변경되었습니다.


관세조사는 정기 관세조사, 비정기 관세조사, 합동조사, 간이조사로 나누어지며, 다음의 경우 정기 관세 조사 또는 비정기 관세 조사를 받게 될 수 있습니다.

정기·비정기 조사의 대상

정기 관세 조사(관세법 제110조의3제1항)

비정기 관세 조사(관세법 제110조의3제2항)

정기적 신고 성실도 분석 결과 불성실 혐의가 있는 경우

신고 등 납세협력의무 불이행한 경우

장기(최근 4년 이상) 관세조사를 받지 않은 경우

구체적인 탈세 제보 등이 있는 경우

무작위추출방식 표본조사를 하는 경우

신고 내용에 탈세나 오류 혐의를 인정할 만한 자료가 있는 경우

합동조사는 조사를 할 때 관세조사 팀과 타 업무팀이 함께 조사 대상 업체에 대하여 통관적법성 등을 조사하는 절차를 말합니다.

반면 간이조사는 관세조사 대상으로 선정된 업체 중 업체의 관세행정 협력도, 성실도, 과거 조사 이력 등을 고려하여 위험도가 낮다고 판단되는 업체를 대상으로 최소한의 해명자료의 요구, 검증 및 방문 조사의 기간을 10일 이내로 축소하여 실시하고 수출입 관련 의무 이행 관련하여 유의할 사항 안내 및 자문 등을 하는 관세조사를 말합니다.

관세조사의 대상이 되었다면, 사전에 준비해 놓는 것이 좋습니다.

h3 img준비 사항

관세조사 통지를 받았다면, 실제 조사 시작 전까지의 준비 기간을 전략적으로 활용해야 합니다.

우선 통지서에 기재된 조사 범위, 대상 기간, 조사 유형(정기/비정기/합동/간이)을 명확히 파악해야 합니다.

이후 해당 범위에 포함되는 자료를 신속히 준비해야 합니다.

특히 관세평가, 세율 적용, 감면 혜택 적용 여부 등에 대한 리스크를 선제적으로 점검하는 것이 좋습니다.

이때 유사 사례나 행정해석을 토대로 내부 입장을 정리해두는 것이 중요합니다.

또한 필요시 관세전문위원, 세무사, 변호사 등 전문가 자문을 통해 조사 대응 전략을 수립해 두는 것이 좋습니다.

이를 통해 조사 당일 혼선이나 불리한 진술을 예방할 수 있습니다.

h3 img사전 준비 체크리스트

사전 준비 체크리스트를 통해 조사 시작 전 충분히 준비해 두는 것이 좋습니다.

▷ 통지서에 기재된 조사 정보 확인
- 조사 범위 / 기간 / 유형(정기·비정기·기획 등)

▷ 조사 대비 주요 자료 정리
- 수입신고서, 거래계약서, 원산지증명서, 회계장부 등

▷ 주요 이슈 사전 점검
- 관세평가, 세율 적용, 감면 혜택의 적법성
- 유사 사례 및 행정해석 검토

▷ 전문가 자문 및 대응 전략 수립
- 관세전문위원, 세무사, 변호사 등과 협력

2. 관세조사 절차별 대응 방법

관세조사 절차 사전통지 관세조사 개시



관세조사의 절차를 이해하는 것은 현명하게 대응할 수 있는 첫 번째 방법입니다.

절차별 대응 방법에 대해 살펴보겠습니다.

h3 img사전 통지 단계

관세청은 조사 개시 15일 전까지 ‘관세 조사 통지서’를 송달합니다.

이 시점부터는 즉시 관세 전문가와 대응전략을 수립해야 하며, 조사범위와 대상기간을 분석하고 내부 자료 정비를 시작해야 합니다.

주요 대응 포인트


▷ 조사 연기 또는 장소 변경이 필요한 경우, 정당한 사유를 갖추어 조속히 신청

▷ 통지서 수령 후 즉시 사내 조사 대응팀 구성 및 법률·세무 대리인의 자문 받기

h3 img조사 개시 단계

조사 당일, 조사공무원의 신분 확인 후 '청렴서약서'를 작성하게 됩니다.

이때 납세자의 권리·의무에 대한 설명이 제공되므로 내용 숙지가 중요합니다.

주요 대응 포인트


▷ 조사범위와 조사자료 제출 방식, 일정 등을 명확히 확인

▷ 모든 질의응답은 기록에 남기고, 불명확한 질문에는 즉답을 피하고 확인 후 답변

h3 img조사 진행 단계

조사기간 동안 납세자는 회계장부, 수입신고서, 계약서 등 관계서류를 요구에 따라 제출해야 합니다.

이때 필요시 관세전문위원 등 전문가의 조력을 받을 수 있습니다.

주요 대응 포인트


▷ ‘관세행정통합민원안내’를 통해 납세자의 권리를 확인

▷ 필요시 의견서 제출 및 법률검토 병행

▷ 실무자는 임의로 해석하여 설명x

▷ 공식 회신자료나 증빙으로 대응

h3 img조사 종료 단계

원칙적으로 예정된 기간 내에 조사가 종료됩니다,

다만 부득이한 경우 연장될 수 있습니다.

또한 조사 종료 전에는 비공식 컨설팅을 통해 오류 보완 기회가 주어질 수 있습니다.

주요 대응 포인트


▷ 조사 내용 요약본 요청

▷ 쟁점 사항을 사전 점검하고 내부 검토

▷ 성실신고 유도를 위한 개선방안, 기업 편의제도 내용 메모 및 활용

h3 img결과 통지 단계

‘관세 조사 결과 통지서’가 송달되며, 과세 예정 내역이 포함될 수 있습니다.

이에 대해 이의가 있는 경우 30일 이내 ‘과세전적부심사’를 청구할 수 있습니다.

주요 대응 포인트


▷ 쟁점 세목과 세액 산정 근거에 대한 법률적 분석을 반드시 병행

▷ 후속 불복절차로 가기 전 유리한 합리적 조정의 기회인 과세전적부심사 적극 활용

h3 img고지서 발부 단계

과세처분이 확정되면 ‘납부고지서’가 발부됩니다.

이때 이의가 있다면 90일 이내 이의신청 또는 심판청구, 이후 행정소송까지 제기할 수 있습니다.

주요 대응 포인트


▷ 과세 사유에 대한 명확한 법리 검토

▷ 사실관계에 기반한 항변논리 정리

▷ 동일 사례가 있는 경우, 이를 인용해 실익 있는 방어 전략 수립

3. 관세조사 결과가 부당하다면

관세조사 결과 불복 법률 정보



관세조사 후 최종적인 납부고지서를 받았는데 부당하다고 생각된다면 사후 불복제도를 통해 불복할 수 있습니다.

이의신청, 심사·심판청구 등이 있으며, 90일 이내에 청구할 수 있습니다.

이의신청을 꼭 거쳐야 하는 것은 아니므로 생략하고 심사 또는 심판을 청구할 수 있습니다.

만약 이를 통해서도 구제받지 못했다면, 90일 이내에 행정법원에 행정소송을 제기하면 됩니다.

이때 청구서에는 부과된 관세 등이 위법 또는 부당하다는 구체적인 의견과 이를 입증할 수 있는 증거자료 등이 제출되어야 합니다.

h3 img대응 전략

법무법인 대륜에는 관세법 관련 전문지식을 보유한 관세변호사가 다수 소속되어 있습니다.

또한 관세전문위원, 공인회계사, 세무사 등 분야별 전문가 역시 다수 포진되어 있어 아래와 같은 조력이 가능합니다.

구분

대응 전략

사전진단

조사 대상 업체의 주요 수출입 거래 구조 파악

회사 내부 시스템 결재 라인 파악

수출입통관실적 분석 및 외환지급영수 연계 검토

품목분류, 과세가격 등 조사 8대 분야 사전검토

방문조사대응

수출입 실무자 인터뷰 및 관세 조사 자료 사전 요청

조사팀 미팅 및 요구 자료 준비

자료 제출 요구에 대한 취지 파악

요구 자료에 대한 회사 측 사실관계 파악

방문조사 후속 대응

쟁점 사안에 대한 대응 전략 수립

자료 제출 전 회사 실무자들과의 사전 미팅 및 대응 방법 안내

조사팀 추가 요청 자료 대응

조사 쟁점에 대한 법령, 판례, 유권해석 등 검토

사후관리

조사팀 과세논리에 대한 비과세 논리 개발

처분검토회의 자료 준비 및 대응 전략 수립

쟁점 분야에 대한 업무 프로세스 재정립

조사 시 쟁점화되지 않았으나 문제 발생 가능성이 높은 분야에 대한 업무 프로세스 재정립


관세에 대한 전문지식을 바탕으로 상황에 맞는 대응 방안을 제시하며 조력을 제공하고 있습니다.

또한 관세 조사를 앞둔 기업에 대해 관세상담과 컨설팅 또한 진행하고 있습니다.

만약 관련 조력이 필요하시다면 언제든 🔗관세변호사에게 자문을 의뢰해 주시길 바랍니다.

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